此次师生相投是如此短暂，不久他们便直接对抗了。梁启超南下广西前，康有为仍然“大声疾呼以主张其平昔之复辟论也，且谓吾辈若不相从，后此恐成敌国”。梁启超认为其师的言论会对他的政治活动造成不利影响，当康有为公开主张复辟时，梁启超严词矙n饬怂睦鲜Γ�“吾既惊其颜之厚，而转不测其居心之何等也。”师生至此公开、正面地决裂了。
护国战争鏖战方酣，康有为等人的复辟活动也在紧锣密鼓地进行着。1917年，张勋复辟，康有为当上了伪弼德院副院长。梁启超则来到了段祺瑞的幕府，充当反复辟军的军师，师生走到了对立面。7月1日，梁启超发出《反对复辟电》，“此次首造谋逆之人，非贪黩无厌之武夫，即大言不惭之书生”，把矛头直指张勋和康有为。复辟失败后，康有为对梁启超恨之入骨，写诗咒骂其为食父母的恶兽，师徒关系断绝。
四、组织事务的龃龉
在长期的政治生涯中，康有为与梁启超在纷繁的日常工作中，难免产生一些磨擦。流亡海外后，康有为创立了保皇会。后来康有为赴加拿大活动，留在日本的梁启超与孙中山交从甚密，拟与革.命檔人联合，他特拟《上南海先生书》，第一次劝老师隐退，“息影林泉，自娱晚景”，康有为闻讯大怒，令梁启超前往檀香山办理保皇事务。梁启超为顾全师生情谊，遵命前往，但康梁的关系从此一直不睦。
1900年，唐才常自立军起义失败后，梁启超前往香港向康有为汇报，康有为把起义失败之责全推到他身上，竟对他“击之以椅”，直打得梁启超跪在地上连连告饶才罢休。康有为专制家长式的粗暴作风对二人的关系起了恶劣的作用。汤觉顿、杨度等人劝梁启超另立门户，而梁启超不愿因具体事务与康有为决裂，师生二人处于貌合神离的境况。
1903年前后，康有为与梁启超因保皇会内部事务又掀起了轩然大波，梁启超不得不就经费和人事问题详加解释，表示“悔改”，这段公案才得以了结。
1904年，康有为情急之下欲借助暗杀手段达到目的，梁启超对此原则上是赞成的，但对康有为用金钱收买杀手的做法却很不以为然，认为既浪费大量金钱，又因所用之人不可靠，收效甚微。
此后的几年，康梁之间表面上是平和的。1905年梁启超筹组政闻社时，向康有为多有请教，康有为则“虚名遥领”。师生间有了一段难得的好时光，在1910年内，康有为给梁启超的信最多。
辛亥革.命打破了师生间的这份宁静，梁启超希望在新的政治形势下有所作为。1912年4、5月份之间，他第二次请康有为退隐，遭到麦孟华的激烈反对，此事遂寝。梁启超此举有避各方对保皇檔攻击的用意，客观上却造成更大的裂痕，师徒至此已分道而行。
综观康梁的交恶，可以看出，是一个多层次的过程。他们在具体事务上的龃龉与整个交往相始终，但不足以使他们各奔东西。学术思想的分野，在到日本不久便泾渭分明，但他们还维持着表面的团结。而政见最终的迥异，及其相关联的国事参与的不同抉择，才是他们异趋的根本原因。但是，二人的决裂是政治上的决裂，梁启超对康有为的师生情却从未泯灭，始终以师礼事之。
五、师生情谊的维系
在日本初期的争论并未减低梁启超对康有为的崇敬之情。1901年，他以深情的笔调作了《南海康先生传》，称颂康有为是先时人物。1911年，康有为来到日本，住在梁启超的寓所。正值他五十五岁生日，“梁启超等十余人连日为寿”。1913年，康有为的母亲去世，梁启超特致函吊唁。1915年，长期追随康有为的麦孟华去世，梁启超闻讯后致书康有为，劝他节哀摄己。1917年因复辟事，师生问询暂告中断。1923年，康有为漫游至天津，梁启超闻讯后三次致信康有为，师生两度会晤，打破了互不往来的僵局。