在南京保卫战爆发前，心知南京无法固守的蒋介石秘密迁都，zf机关开始陆续向武汉一带转移。时任国民zf主席的林森已带相关zf机构抵达重庆，重庆作为战时临时首都的陪都角色已内部确定。为了保存实力，避免出现淞沪之战那种不惜血本以致家底赔光的惨剧再度发生，蒋介石将大批空军战机与大量的通讯器材运往后方。这为后来南京之战爆发后中国军队缺乏制空权，缺乏通讯交流的败因埋下了伏笔。
守不守南京？国民檔内部几乎一边倒主张放弃这座孤城。以足智多谋著称的白崇禧旗帜鲜明地对蒋介石说：“部队在上海都打残了，退到上海外围还没喘过气来，在这么短时间内根本无法恢复元气，更谈不上打一场艰苦的保卫战，你要听我的话，南京，干脆放弃算了！”
连对蒋介石惟命是从的嫡蠙n鲁弦膊煌饧崾兀鲁虾芑崴祷埃�“我虽然不知道领袖的意图，但我可以保证，领袖让我守，我坚决打到底！领袖叫我撤，我决不在南京多待一分钟！”闻此言，在座的国民檔高官一片哗然：“简直是屁话！等于没说！”
其实，蒋介石自己也不想再硬挺下去，但放弃首都南京的丧气话，是无论如何也不能从他口中藱n龅摹Ｋ枰幸桓鑫ジ住⒊懦∶娴娜耍飧鼋巧翟谑翘颜伊恕�
最开始，他相中了带兵来援的四川军阀刘湘，没想到刘湘被部下一撺掇，忌惮蒋介石借此剪除异己，于是朗意装病推脱，无论蒋介石如何劝说，均无效。
桂蠙n錾淼牟文弊懿孔髡阶樽槌ち蹯吃诰禄嵋樯匣构室善鸾槭闹喂铰岳矗堑美辖淮笈�“那好吧，既然你们这么畏战，那就由我来守南京！”蒋介石一时激动，脱口说了句气话。
关键时刻，唐生智站了出来，慷慨激昂地说：“诸位，南京的确是一块绝地，但你们恐怕忘记了南京是一座什么样的城市吧？这是我们的首都！是孙总理的陵墓所在地！作为军人，我们怎么可背弃国父的教诲，为了保卫国父的陵墓，哪怕战至最后一人，也要死守南京！”唐生智历来特立独行，曾数次反蒋遭罢黜，而在抗战的危难时刻，却能挺身而出，令众人一时刮目相看。
事后有人推测，唐生智此时出头，多半是想火中取栗，目的是重掌军权。但蒋介石此时已顾不得那么许多，立刻委任唐生智出任南京卫戍司令长官
唐生智到南京上任后，制定了“焦土抗战”的防御策略。其核心为：第一，为扫清射击视线障碍，将南京城外的树木、民房全部烧光；第二，为了不让敌人接近城墙，须拒敌于城外10公里处；第三，从现在起，立刻对部队进行班防御、连防御的实战性训练。
为了表示誓与南京共存亡的决心，唐生智令宋希濂率部断掉南京守军的退路，烧掉渡船。声称，若无命令，擅自离队渡江逃离战场者，格杀勿论！
事后看，包括唐生智本人在内的诸多守城高官均给自己预留了逃生船只，真正无路可退的不是这些带兵的将领，而是沙场浴血的一线官兵。前些年，作家方军曾写过一本书，名为《我认识的鬼子兵》。在日本采访时，一些参加过侵华战争的日本老兵直言不讳地对他说：“国民檔军队有个习惯特别不好，一打败，当官的先跑！”
日本zf本没有攻占南京的计划
长期以来，国内研究中国抗战史时，总以为日本内部在侵华问题上是铁板一块，似乎日本侵华的每一项指令与举措都是自上而下的。
实际上，在侵华问题上，日本国内上下虽有共识，但具体方略、实施手段却大相径庭。zf中的文官集团主张渐进渗透，军人集团却力主用快速高效的战争手段消灭中国的抵抗力量。而军人集团对待侵华也存在分歧，军部、参谋本部并不奢望一口吞掉庞大的中国，还是希望通过局部性的战争不断消耗中国军力，通过签订有利于日本的不平等条约巩固胜利成果，为最后全面吞并中国做渐进性积累。而一线官兵却扬言毕其功于一役，往往擅自修改上司指令，以下犯上越权行事，从“九·一八”事变到南京之战，一线日军屡屡抗命扩大战争规模，日本军部居然被基层部队牵着鼻子走，最后被迫默认现实。