这次事件，可看做是朱翊钧与张居正这一对君臣关系的转折点。此前，朱翊钧对张居正深为倚赖，信任有加；此后，他对张居正除了敬畏，更在内心中潜藏了一份不满。
不过，张居正活着，神宗心底惧怕，阴影在胸，自然不敢有什么动作。张居正一死，神宗虽说还装模作样地大哭了一场，可是他很快就擦干眼泪，开始报复了。他积聚了十几年的不满和怨恨，突然爆发。他的第一个动作，就是从张居正任用的干部开刀的。什么事儿解恨，他就怎么干。于是，张居正一家就入地狱了。
张居正是以为成功的宰相，但是不是一位优秀的老师。他拯救大明王朝于危难之中，励精图治，使大明王朝重振雄风。而他作为帝师，在教育皇帝上面却是失败的。他并没有把自己的学生（即万历皇帝朱翊钧）教好，或者说是他的教育方式不对，尔致万历对他产生反感，甚至一直想“打倒”他，所以万历并没有成为一个优秀的学生，也没有成为一个优秀的皇帝。
直到晚年，万历皇帝对张居正还心怀不满，张居正在幼年给他带来的心理阴影始终挥之不去。