林则徐成为钦差大臣之后，引起弛烟派和满州贵族不满，但碍于道光帝的皇威，不敢公开反对，只得暗中阻挠。弛烟派首领琦善向林则徐威迫利诱，后人记述当时的状况：
龚自珍亦对林则徐的安危担忧，他提议林则徐带同重兵巧匠，一旦发生战争，便可即时还击，更愿随林则徐一同南下，但林则徐不愿他卷入政治旋涡，婉拒了龚自珍的好意。
两广总督邓廷桢，广东巡抚怡良通力合作，发布道光帝圣旨，查封烟馆，逮捕烟贩，下令处死了中国烟贩冯安刚。林则徐最大的阻力是怡和洋行的威廉·渣甸及宝顺洋行的兰士禄·颠地。威廉·渣甸为阻止林则徐，回到英国，游说zf对清廷采取强硬行动。林则徐一明白人称“铁头老鼠”的威廉·渣甸离去便高兴表示：“铁头老鼠，狡猾的yp走私头目，畏惧天朝的愤怒，已经回到烟雾之地。”
封锁
道光十九年正月廿五（1839年3月10日），林则徐正式抵粤，受九响礼炮之礼，所有广东高官员皆来迎接。美国商人威廉·亨德也在附近观礼，他留下了有关林则徐相貌的重要文献：“气度庄重，表情相当严厉，身材肥胖，上唇浓密的黑短髭，下巴留着长髯，看来六十岁左右。”林则徐首先参观越华书院，并提了一对对联：“海纳百川，有容乃大壁立千仞，无欲则刚”。
众yp烟商以为贿赂就能打动新来的钦差大臣，偏是林则徐就与历来的官员不同，视钱财
林则徐上半像如无物，他限定所有烟商三日内交出全数yp，并签切结书，声明以后不贩yp，保证：“嗣之后船永不敢夹带yp，如有带来，一经查出，货尽没官，人即正法，情甘服罪。”少数的烟商屈服，交出yp，但大部份的烟商，包括官府差役、胥吏查办，皆无所动。林则徐便宣告：“若yp一日未绝，本大臣一日不回，誓与此事相始终，断无中止之理。”林则徐不假差役胥吏之手，知知识界的士人与他同一阵线，召粤秀书院、越华书院、羊城书院三大书院六百四十五学子入贡院“考试”。这次名为考试，实为问卷调查，试题四道：“1．yp集散地及经营者姓名；2.零售商；3.过去禁烟弊端；4.禁绝之法。”自此林则徐掌握了所有烟商、贪官污吏之名单。
禁烟期间，林则徐写了一封致维多利亚女王的照会，质问女王明知yp有害，在国土上包括伦敦、苏格兰和爱尔兰等地不产yp，严禁国民吸食(注:实际上英国严禁yp吸食要到1912年的yp公约透过才实行)。。但却在其管辖的印度种植生产yp，批准国民在中国进行yp贸易。他要求女王去除印度的yp，并通知女王中国已经透过《钦定严禁yp烟条例》，全面禁烟，使英国国民放下yp贸易。
外国烟商认为交少量yp给林则徐交差便了事，于是采取施延手法，称对命令要详加思考，成立委员会作报告，七日内回复。林则徐十分气愤，限令烟商依时交出yp，否则翌日十时亲到十三行审判外国烟商。美国
烟商表示愿随林则徐指示，遭兰士禄·颠地阻止。结果三日之后，烟商决定象征性*交出一千零三十七箱yp。于是邓廷桢下令封锁广州海岸，围困十三行，兰士禄·颠地意图逃走，被邓廷桢活捉。
其时商务总监为查理·义律，他一听到十三行被围困，立即从澳门赶到广州。义律只见十三行皆有人把守，便提剑闯入，看守人只得放行，但绝不让他走出来。林则徐下令十三行内所有华人迁出，断绝通信，断水断粮。十三行内有350名外国人，只得亲自去烹调、洗涤、铺床、擦灯、挑水、挤牛奶，做平时根本不用动手做的家务。
二月十一（1839年3月25日），义律屈服，愿意约见任何一名官员。广州知府与他见面，但义律又不出现。林则徐向义律作最后通牒——《示谕外商速交yp烟土四条稿》，痛斥义律，义律最最后二月十四（1839年3月28日）朝早六时服从林则徐之命令。向林则徐呈送了《义律遵谕呈单缴烟20283箱禀》；从林则徐3月10日到达广州，到义律3月28日被迫同意缴出全部yp，总共18天。
但是义律留有后著，他不让外国烟商直接交yp给林则徐，而是先交给他，再以“以不列颠女王陛下zf的名义”缴出yp，连利息、运费一共20238箱yp。令商覚n逋槐湎喑芍杏⒘酱蟮酃某逋弧�
封锁十三行事件后被写入《南京条约》，并以此为借口索取赔款600万银元。条约写道：“四、因大清钦差大宪等于道光十九年二月间经将大英国领事官及民人等强留粤省，吓以死罪，索出yp以为赎命，今大皇帝准以洋银六百万银元偿补原价。”