这个官司到了后来，纪晓岚等人编纂的《四库全书总目·子部·医家类一》的时候，认为孙思邈应该出生于公元581年——也就是说，孙思邈活了101周岁，102虚岁。可如何解决《新唐书》和《旧唐书》中记载的“周洛州总管独孤信见其少，异之，曰：‘圣童也，顾器大难为用尔!’及长，居太白山。隋文帝辅政，以国子博士召，不拜。”的这段故事呢?纪晓岚等人认为是“史误审矣”。
这样一来，看来是什么问题都解决了，可还是有个问题：
孙思邈在写《千金方》卷二十七的时候说：“余年已过百”，而《千金方》成书于公元652年，岂不与生于581年其时70岁相差甚远吗?
哎呀，这个孙思邈到底出生于哪一年，到底活了多大岁数呢?咳，我也不明白。不过，有一点我是明白的：这个孙思邈真的活了一百多岁。当然了，我个人还是倾向于孙思邈活了101岁——虽然我希望他活到141岁!为什么啊?因为我的老师就是这么教我的啊，而且现在的中学历史教科书也是这么写的啊!
隋大业（605～618）中，游蜀中峨眉。隋亡，隐于终南山，与高僧道宣相友善。
唐太宗李世民即位，召至京师，以其“有道”，授予爵位，固辞不受，再入峨眉炼“太一神精丹”。显庆三年（658），唐高宗又征召至京，居于鄱阳公主废府。翌年，高宗召见，拜谏议大夫，仍固辞不受。咸亨四年（673），高宗患疾，令其随御。上元元年（674），辞疾还山，高宗赐良马，假鄱阳公主邑司以属之。
永淳元年卒，遗令薄葬，不藏明器，祭去牲牢。
宋徽宗崇宁二年（1103）追封为妙应真人。
孙思邈7岁时读书，就能“日诵千言”。每天能背诵上千字的文章，到了20岁，就能侃侃而谈老子、庄子的学说，并对佛家的经典著作十分精通，被人称为“圣童”。但他认为走仕途，做高官太过世故，不能随意，就多次辞谢了朝廷的封赐。隋文帝让他做国子博士，他也称病不做。唐太宗即位后，召他入京，见到他50多岁的人竟能容貌气色、身形步态皆如同少年一般，十分感叹，便道：“所以说，有道之人真是值得人尊敬呀！像羡门、广成子这样的神仙人物原来世上竟是有的，怎么会是虚言呢？”皇帝还想授予他爵位，但仍是被孙思邈拒绝了。高宗继位后，又邀他做谏议大夫，也未被允。孙思邈归隐的时候，高宗又赐他良驹，还有已故的鄱阳公主的宅邸居住，就连当时的名士宋令文、孟诜、卢照邻等文学大家都十分尊敬他，以待师长的礼数来侍奉他。
玄武门之变发生于唐高祖武德九年（626年）。唐太宗即位之后怎么也应该在627年后召见的孙思邈。按传说孙思邈出生于541年的话，此时的他应该已经80多岁高龄了。再者二十三年五月，太宗去世，李治即位，是为唐高宗，时年二十二岁。次年（650年）改元永徽。这时高宗怎么可能邀请一百多岁高龄的孙思邈做谏议大夫？所以说传说生于541年死于682年是不成立的。据推算应该是生于570年左右，死于740年左右。
一次，卢照邻问了老师一个问题：“名医能治愈疑难的疾病，是什么原因呢？”孙思邈的回答十分精彩，也足见其医学上的造诣颇深。他答道：“对天道变化了如指掌的人，必然可以参政于人事；对人与体疾病了解透彻的人也必须根源于天道变化的规律。天候有四季，有五行，相互更替，犹似轮转。那么又是如何运转呢？天道之气和顺而为雨；愤怒起来便化为风；凝结而成霜雾；张扬发散就是彩虹。这是天道规律，人也相对应于四肢五脏，昼行夜寝，呼**气，吐故纳新。人身之气流注周身而成营气、卫气；彰显于志则显现于气色精神；发于外则为音声，这就是人身的自然规律。阴阳之道，天人相应，人身的阴阳与自然界并没什么差别。人身的阴阳失去常度时，人与体气血上冲则发热；气血不通则生寒；气血蓄结生成瘤及赘物；气血下陷成痈疽；气血狂越奔腾就是气喘乏力；气血枯竭就会精神衰竭。各种征候都显现在外，气血的变化也表现在形貌上，天地不也是如此吗？”
孙思邈还对良医的诊病方法做了总结：“胆欲大而心欲小，智欲圆而行欲方。”“胆大”是要有如赳赳武夫般自信而有气质；“心小”是要如同在薄冰上行走，在峭壁边落足一样时时小心谨慎；“智圆”是指遇事圆活机变，不得拘泥，须有制敌机先的能力；“行方”是指不贪名、不夺利，心中自有坦荡天地。这就是孙思邈对于良医的要求。其实，何止于医者，仅从为人的角度上来讲，恐怕要做一个有气度、有担当的人，也不悖此道吧！