一般情况下，廉租房要比公租房的租金要低上很多。廉租房月租金标准约为0.8-1.2元/平方米。而公租房则根据地段不同，租金也有变化，一般是同地段同品质房屋的60%。不同城市公租房和廉租房租金缴纳金额不同，具体依据本地政策执行。
第五、申请条件不同
以郑州公租房为例，家庭成员中至少有1人取得本市常住户口3年以上；家庭成员有户口迁入的，迁入时间必须在两年以上；无自有住房或未租住公有住房；家庭人均月收入低于城镇居民最低生活保障标准的5倍，单身年龄应在28岁。另外，就业职工及外来务工人员其他各自条件，如已与用人单位签订劳动合同，月工资低于城镇居民最低生活保障标准的5倍等等。而廉租房则除了对户口有要求外，还需有《城镇居民最低生活保障金领取证》或者家庭人均月收入低于郑州市城市居民最低生活保障标准的2.5倍的低收入家庭认定证明，人均住房建筑面积低于16平米。
第六、申请对象不同
不同城市申请对象不同。例如北京廉租房申请对象必须满足如下情形：a、申请家庭上年人均月收入连续一年低于580元。1人户家庭年收入低于6960元，2人户低于13920元(申请家庭每增加1人，按增加6960元计算)。b、申请家庭总资产为1人户家庭低于15万元，2人户低于23万元，3人户低于30万元，4人户低于38万元，5人户及以上低于40万元。 c、家庭住房人均使用面积低于7.5平方米，且申请人和家庭成员5年内未出售或者转让过房产。d、具备下列情形之一：被拆迁；有特殊病、重残人员；有60岁(含)以上人员；居住市zf确定的解危排险范围内房屋；申请楼房配租的家庭人口应当在2人以上。
保障性住房发展趋势
廉租住房和公共租赁住房是保障性住房的重要组成部分，对满足城镇中低收入住房困难群体的基本住房需要发挥了重要作用。但在平行运行过程中也遇到了一些问题：
一、两种保障房都属于租赁房，但面向的群体不完全一样，需要分别申请、分别排队，申请人不容易搞清楚自己适用哪种保障方式，导致申请不够方便。
二、住房保障需求和供应是一个动态的过程，近年来部分地方出现了保障房与保障对象不相匹配的情况。如果廉租房或公租房房源在满足保障对象需求后仍有剩余，受限于两项制度准入门槛、保障标准不同，不能调剂使用，在一定程度上造成了资源的闲置浪费。
三、对于因收入等发生变化需要从廉租房对象转换成公租房对象的，需退出原廉租房保障后再申请新的公租房保障，给老百姓造成不必要的麻烦。
为了解决这些问题，近年来，一些地方在廉租房和公租房统筹建设、并轨运行方面做出了积极探索。例如深圳市下发了《深圳市公共租赁住房和廉租住房并轨运行实施办法》，确认公租房廉租房并轨制度，廉租保障对象可以自行承租市场房源，领取相应的市场房租金补贴。而廉租保障对象承租公租房的，按照其所承租公租房租金标准的90%向其发放公租房租金补贴。