事后,纪氏怀孕。宠冠后宫的万贵妃知道后,命令一宫女为纪氏堕胎。纪氏的人缘很好,派来的宫人不忍下手,回报万妃时就谎称是肚内长了瘤子而不是怀孕,万贵妃仍不放心,下令将纪氏贬居冷宫。纪氏是在万贵妃的阴影下,于冷宫中偷偷生下了朱佑樘,万贵妃得知后又派门监张敏去溺死新皇子,但张敏却冒着性命危险,帮助纪氏将婴儿秘密藏起来,每日用米粉哺养。
当宪宗皇帝第一次见到自已那因为长期幽禁,胎发尚未剪、拖至地面的瘦弱的儿子,不禁泪流满面,感慨万千。当天召集众臣,藱n稣嫦唷４稳�,颁诏天下,立朱祐樘为皇太子,并封纪氏为淑妃。但随之纪氏却在宫中暴亡,门监张敏也吞金自杀。显然,纪妃与张敏之死皆与万贵妃的迫害有直接关系。
宪宗的母亲周太后担心万贵妃会对太子下毒手,就亲自将孙子抱养在自己的仁寿宫内,才使太子安全地生活在宫中。由于幼年生活的坎坷,孝宗一直身弱多病。但孝宗却勤于政事,不仅早朝每天必到,而且重开了午朝,使得大臣有更多的机会协助皇帝办理政务。
朱见深是明代历史上第一个不上朝的皇帝，他跟后世的那些不朝的皇帝还是有区别，区别就在于原因上。后世不上朝的皇帝大多因为体制方面的原因，而这位皇帝的不上朝却是由于一些难以名状的原因。
朱见深自小幽闭在宫中，由万氏抚养长大，他得了很严重的自闭症，他害怕见生人，他上朝的时候看见那么多人他会紧张。不仅如此，他信道教，每天天没亮他就要起床做功课，正是因为这些因素，他厌倦上朝。难得上了一次朝，内阁首辅万安了解皇帝的心思，当其他群臣好不容易见了皇帝一面，有很多话要奏给皇帝听时，万安却连忙跪下来三呼“万岁”，眼看首辅如此，其他群臣也只好跪安。所以，成化朝万安得了个“万岁阁老”的称呼，眼见万安如此，内阁其他二人刘珝、刘吉也只好跟着捣浆糊，所以人们又送内阁一个雅号“纸糊三阁老”。从天顺年间起，内阁大学士逐渐兼任各部尚书，所以人们又称六部尚书为“泥塑六尚书”，到了此刻，我们的王朝从皇帝到大臣都开始奉行无为而治。
早已倦怠政事的朱见深开始对神仙鬼怪发生了浓厚的兴趣，他喜欢修真，希望能够长生，即使不能够长生，也希望能够长寿。
成化十九年，见深召见了神仙王士能，王士能说他是江苏灌云县人，生于故元至正年间，今年一百二十岁了，但看起来却像四十岁的人。王士能告诉见深，自己年轻的时候在四川的一处雪山中遇到一位异人，异人只有三尺长，却鹤发童颜、形如婴儿，王士能伺候老人三年，老人才教授他长生之术。见深问道长生之术为何物，王士能说道“不食荤、不近女色、不贪财、不生气”，皇帝听说后觉得难度太大，便打发王士能回了去。
除了王士能，还有个尹继先。尹继先自称生于南宋绍兴年间，已经三百多岁。不过从现代医学角度来讲，一百二十岁已经是人类寿命的极限，如果说王士能的寿命长度还有可能，那么这位尹道士绝对是自吹自擂。
这些清心寡欲的修真人士不对朱见深的胃口，他更喜欢跟一些会玩魔术的方士搅在一起。这些方士都是朱见深让太监去民间找来的，李孜省是他们其中的杰出代表。李孜省本是地方官吏，因为犯了法正被通缉，躲到京城来了，不知道怎么回事让出宫寻找方士的宦官撞见了，便带到宫里来。李孜省自称他会道教的“五雷法”，善以符箓治病。这“五雷法”是道教的祈雨法术，能够将天上雷公召唤出来降雨。宪宗让李孜省演示，李孜省的祈雨法术时灵时不灵，大概他也懂一些天文知识，知道什么时候会下雨，什么时候不会下雨。李孜省又说他会“扶鸾术”，这“扶鸾术”是道教请仙的法术，主要是将天上的神仙请下来。见深对这一法术也异常感兴趣，便让李孜省表演，李孜省跪在地上焚香祷告，不大一会，屋檐上出现两名仙女，见深连忙让两名仙女下来，两名仙女下来后，仔细一看，原来是垃里的宫女，顿时让人大跌眼镜。