人面呈圆形，由人、鱼合体而成。头顶有似发髻的尖状物和鱼鳍形装饰，装束奇特，像是在进行某种宗教活动的人物形象。该器物在新石器时代前期，多作为儿童翁罐的棺盖来使用，因此考古学家认为“人面鱼纹”象征着巫师请鱼神附体，为夭折的儿童招魂祈福。
《山海经》记载：“有鱼偏枯，名曰鱼妇。颛顼死即复苏。风道北来，天及大水泉，蛇乃化为鱼，是为鱼妇。颛顼死即复苏。”据说在颛顼死去的时候，刚巧有大风吹来，海水被风吹得奔流而出，颛顼便趁机化成鱼，死而复生。在先秦典籍《诗经》《周易》也中有将鱼隐喻为“男女相合”的记载，《太平御览·风俗通》曰：“伯鱼之生，适用鐀孔子鱼者，嘉以为瑞，故名鲤，字伯鱼。”可见，鱼是生命力、是繁衍的象征。
此外，“双鱼”也是佛教八吉祥之一。鱼行水中，畅通无碍。佛教以其喻示超越世间、自由豁达得解脱的修行者。藏传佛教中，常以一对金鱼象征解脱的境地，又象征着复苏、永生、再生等意。
在“双鱼玉佩”的发现地也曾出现过奇异的现象，根据当地居民的反映，此地曾发生过天气异常，地表环境在短时间内发生了重大的变化，而后又恢复成了原来的状态。该地曾出现过大量由当地居民复制而来的镜像人。