2014年，李明远在当年百度世界大会上隆重推出了直达号，但效果并不理想。2015年10月8日，美团和大众点评联合发布声明，正式宣布达成战略合作，双方已共同成立一家新公司，新公司将成为中国O2O领域的领先平台。
至此，百度O2O深陷险境：随着行业老大和老二合并，百度O2O业务将面临一个更加凶悍的竞争对手。
移动互联网探索成果寥寥及O2O业务的失利最终导致李明远在百度内部失势。
2016年4月13日，百度进行了距今最近的一次组织架构调整，其中最大的变化是成立“百度搜索公司”，下辖副总裁向海龙负责的“搜索业务群组”（SSG）、副总裁李明远负责的“移动服务事业群组”（MSG），以及副总裁曾良负责的糯米事业部。
其中，李明远汇报对象的变化更引发外界关注：之前直接向李彦宏汇报的李明远，将改向向海龙汇报工作。
但是在宣布架构调整的内部邮件中，李彦宏仍对李明远表示了肯定和鼓励：明远是百度自己培养起来的年轻管理者，带领MSG在移动转型路上做出了很大的贡献。希望明远在未来能够与海龙紧密合作，在更具挑战的战场上敢拼敢打，做出更大的成绩。
现在看来，这已经是李彦宏最后一次对外传达肯定李明远的立场。
移动业务发展不力或许只是诱因，真正让李明远出走百度的是其所涉的内部经济问题。
去年开始，百度内部反腐力度加大。
2015年5月12日，百度内部邮件披露数位员工涉嫌商业受贿或职务侵占被公司解除劳动合同，并被移交至相关司法机关依法处理。今年4月，百度内部邮件称，副总裁王湛因违反职业道德被开除。当时有外界猜测，王湛被开除或与此前百度游戏事业部总经理廖俊利用职权涉及不正当交易有关。今年9月，百度职业道德委员会向全体员工发了一封通报邮件，详细列举了17条内部违法违纪行为，涉及员工30人。
百度内部内部反腐愈演愈烈，最终这把火烧到了李明远的头上。
2016年9月1日，百度世界大会在北京举行，这是百度每年最重要的一次发布会，在这个发布会上，百度创始人、CEO李彦宏以及百度重要业务的负责人均会“出门见客”，为外界讲述百度对未来战略的思考，以及接下来的发展重点。
曾经是百度世界大会主角的李明远这次却并未出现在演讲嘉宾栏，对此百度方面的解释是：百度当下的发展重心是人工智能，明远主要负责的是移动业务，因此不演讲很正常，而且他虽然没有演讲但是也参加了大会。
此后，李明远离职百度的传闻曾几度传出，面对传闻，百度公关曾对腾讯科技明确否认，10月26日，网络再次传出李明远已离职百度的传闻，面对腾讯科技的询问百度公关此次给出的回应是“不予置评”。但一位百度员工对腾讯科技表示，最近在公司遇见过李明远。
然而一周过去以后，百度在今天扔出了揭露李明远涉内部经济问题的重磅炸弹，围绕这位昔日“太子”的离职传闻终于得到终结。