内部邮件中显示，李明远引咎辞职的原因有：在参与公司某收购项目中，与被收购公司负责人有私下巨额经济往来；在其所管理的业务范围内，与某游戏合作伙伴的负责人有私下巨额经济往来。同时，李明远个人投资参股的外部公司与百度有业务关联，未按公司制度报备。
对此，李明远昨日晚间在朋友圈发声，回应自己没有任何的贪腐，有经济往来但不是不正当的经济往来。李明远还在回应中表示“以前我在百度，你们黑我，我不能因为个人情绪回应说什么”，似乎暗示此次事件有人故意抹黑他。
2013年7月，百度宣布将全资收购网龙控股子公司91无线，总价为19亿美金（约合116.636亿人民币），尽管当时百度正苦于没有移动互联网入口，但19亿美金收购的价格仍高得有些不合情理。
为此，一度有传闻流出百度收购91无线或存在吃回扣现象。此次李明远被内部通报“与被收购公司负责人有私下巨额经济往来”，也因此引发猜测。
据腾讯科技调查，李明远共于12家企业担任法定代表人，共投资9家企业，共任职19家企业，集中在科技推广和应用服务业。
利益纠葛的灰色地带
在李明远任法定代表人的12家企业中，百度旗下公司共8家，另外4家企业分别经营企业文化设计、新媒体传播、无线互联网应用开发以及计算机软硬件的开发与销售等业务。
值得注意的是，李明远投资的9家企业中包括畅香利泰（北京）餐饮管理有限公司与北京味美曲香餐饮管理有限公司，这两家公司的主要业务分别是黄太吉与叫个鸭子两个互联网餐饮业务。
资料显示，李明远于北京味美曲香餐饮管理有限公司担任监事，而“叫个鸭子”相关人士也向腾讯科技证实，李明远以个人身份参与了此项目的投资。
黄太吉创始人赫畅与李明远关系颇近，赫畅于2005年加入百度用户体验部门，常常和李明远一起开会。赫畅曾回忆，有一回他发起了关于“百度知道”一系列设计的会议，由于准备仓促，会上很多讨论陷入僵局，李明远“挺身而出”，替他打破僵局，帮助他开完会议。
赫畅在2015年曾对媒体透露，黄太吉单量占百度外卖的7%。
叫个鸭子创始人曲博同样与李明远、百度颇有渊源，其为与李明远同年进入百度的实习生，在百度十年，其中有四年在贴吧。
而此次通报李明远引咎辞职的邮件中则提及“李明远个人投资参股的外部公司与百度有业务关联，未按公司制度报备”。
另外，腾讯科技调查显示李明远于天津畅玩网络科技有限公司担任董事长，天津畅玩旗下有18183手机游戏网、特玩游戏网、页游天下游戏网以及核弹头小游戏网。业务覆盖包括手游，端游，页游及小游戏等各个方面，为游戏玩家提供资讯、攻略、礼包、账号等服务。
根据百度移动游戏的官方介绍：18183手机游戏网为其重要入口。
百度移动游戏业务源于百度收购91无线后拿下的游戏门户，游戏发行业务被百度多酷兼并，逐渐发展成百度移动游戏。2015年12月，百度构架调整。移动游戏及百度贴吧转入百度MSG事业群组，李明远为MSG事业群总经理。