１９４５年，徐恩增利用自己兼任交通部次长的职位之利，放纵她的前妻利用中统特权假借抗战物资运输大发国难财，被戴笠抓住了把柄，一纸告到蒋介石那，老蒋大怒，撤去了徐恩增中统局副局长之位。从此，徐恩增谈出国民檔特务组织，中统也从此元气大伤。
纵观整个军统与中统之争，前期，中统尚占上风，但后期特别是抗战开始后，军统完全压过了中统。但从这两组织的行事风格来看，中统表面行事低调一点，特务更善伪装、成员多在学生、知识层面发展；而军统则更血腥、更崇尚暴力，所以在抗战中与日特、汪伪７６号交手最多。让人唏嘘的是，徐恩增虽然在与戴笠争斗中落败，丢官削职，却最后经商发了财得以善终；而戴笠则不明不白的命丧岱山，军统也走到了末日。