1955年6月孙立人因卷入反对蒋介石的兵变案被软禁，随着孙案的爆发，孙立人的一切事迹，遭到国民檔zf的历史删除，1988年台监察院认定孙立人无叛乱意图。其实孙立人和蒋介石早有矛盾，孙立人他崇尚西方军事思想，抵制国民檔的治军方法，反对蒋经国在军中建立“政工制度”，反对加强特务统治；对蒋介石“对攻大陆”的说法也不以为然，主张“先将台湾搞好再说”。这些导致他与蒋氏父子的矛盾加大，兵变只是给了蒋介石软禁孙立人一个借口。
孙立人，生于安徽省庐江县金牛镇。先后毕业于清华大学、美国弗吉尼亚军事学院。中华民国陆军二级上将军衔，第一次缅战时任38师师长，在孟关杰布山隘间战役毙敌2000余，孟拱河谷战役击毙日军12000余，第二次入缅作战时任新一军军长，攻克八莫、南坎、老龙山、南巴卡、新维、腊戍、乔美等地，共击毙日军3万3千余，是抗战中军级单位将领中歼灭日军最多的将领，有“丛林之狐”、“东方隆美尔”的美称。内战时曾于四平、公主岭、德惠等地击败林彪。
孙立人从一开始就是历民檔军队中的异类，受过高等教育、美国弗吉尼亚军事学院毕业。而其他国军将领基本上三个来源，保定军校、日本陆大、黄埔军校，这样一来孙立人在军中老哥一个，没有同窗扶持，显得格格不入。而且孙立人回国后从财政部税警总团发迹，可以说是宋子文的嫡系，不是蒋介石的人。
1932年“一·二八”抗战的时候税警总团以第88师独立旅的身份参战，战功卓著。
1937年全面抗战爆发。9月税警总团开拔奔赴淞沪会战前线。税警总团驻守蕰藻浜（吴淞江北支流），后因侧翼被优势日军突破，被迫退守苏州河（吴淞江南支流）南岸。成功阻击日军橡皮艇七次渡河。之后孙立人在苏州河周家宅一线血战中被日军火炮炮击成重伤，全身中弹片十三处，昏迷三天。
次年伤愈后又率部参加了保卫武汉的战斗，两次立下战功，从此便在军界崭露头角。国民zf迁都重庆后，孙立人奉命赴长沙重组税警总团，并担任总团长。重组的缉私总队为淞沪会战后伤愈之税警总团残兵（未受伤的被团长黄杰带走改组为40师）加上新募为主，规模3团，经过两年严格的训练，孙立人将缉私总队由原本之三团残兵新兵逐步扩张至六个团规模。
蒋介石非常忌讳宋子文插手军权，1941年12月财政部被迫交出部分缉私总队半数兵力给国民革.命军重组为新编第三十八师，作为交换条件由原本财政部体系的孙立人晋任少将师长，隶属于第六十六军，这支部队成为中华民国当时的主力部队之一。
1942年2月，中国远征军成立，下辖第5军、第6军和第66军。4月，孙立人率新38师抵达缅甸，参加曼德勒会战。
1942年4月17日，西线英军步兵第1师及装甲第7旅被日军包围于仁安羌，粮尽弹缺，水源断绝，陷于绝境，孙立人奉史迪威之命派113团团长刘放吾率团星夜驰援。18日凌晨，孙立人亲自从曼德勒赶往前线指挥113团向日军发起猛烈攻击，至午即攻克日军阵地，歼敌1个大队，解了7千英缅军之围，并救出被日军俘虏的英军官兵、传教士和新闻记者500余人。仁安羌之战是中国远征军入缅后第一个胜仗，孙立人以不满1千的兵力，击退数倍于己的敌人，救出近7倍于己的友军，轰动全球。
但也是在这个时候孙立人得罪了蒋介石。中国远征军首次入缅甸作战失利，蒋介石严令军队必须回国，杜聿明率军通过野人山回国3万将士死在野人山，而孙立人则不听蒋介石号令率新38师向西撤退到印度，后编为驻印军。
孙立人一方面得罪了杜聿明以至于内战时受到排挤，另一方面深深得罪了蒋介石。只不过之后孙立人战功卓著打的日本人丢盔弃甲，又深受美国人看重，蒋介石不得不给于重用。
抗战胜利后，新1军与新6军被调往东北进行内战，凭着优势武力，曾在作战初期取得上风，不过却因与司令杜聿明不和，战功被漠视，孙立人与杜聿明爆发直接冲突，蒋介石趁机将孙立人调回南京国防部任职，实际已远离战场。
国民檔败退台湾，蒋介石一方面倚重孙立人的能力，另一方面也是利用孙立人在美国军界的关系（马歇尔、巴顿都是孙立人的校友）被迫再次启用孙立人。